Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSDE1O75534 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSDE1O75534 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms