Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms