Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXD2O60548 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD2O60548 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms