Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLXNC1O60486 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLXNC1O60486 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLXNC1O60486 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms