Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP104O60308 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP104O60308 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP104O60308 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP104O60308 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP104O60308 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP104O60308 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP104O60308 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP104O60308 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms