Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms