Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1O43719 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1O43719 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms