Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATCO43716 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATCO43716 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GATCO43716 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATCO43716 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATCO43716 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATCO43716 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATCO43716 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms