Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51CO43502 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD51CO43502 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms