Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SYNJ1O43426 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms