Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRXO43186 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRXO43186 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRXO43186 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRXO43186 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRXO43186 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRXO43186 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRXO43186 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRXO43186 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRXO43186 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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