Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFDN6O15212 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PFDN6O15212 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms