Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TULP1O00294 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TULP1O00294 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP1O00294 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP1O00294 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP1O00294 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP1O00294 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP1O00294 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP1O00294 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TULP1O00294 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TULP1O00294 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms