Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QQQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QQQ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QQQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QQQ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QQQ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QQQ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QQQ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QQQ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms