Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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