Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB9F8W1W9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms