Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B4E171 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4E171 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4E171 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4E171 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4E171 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4E171 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4E171 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4E171 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4E171 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4E171 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4E171 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4E171 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4E171 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms