Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM114B3SHH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM114B3SHH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM114B3SHH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM114B3SHH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM114B3SHH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM114B3SHH9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM114B3SHH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms