Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms