Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms