Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C5orf60A6NFR6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C5orf60A6NFR6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms