Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMB4A4D0S4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMB4A4D0S4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms