Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM89A2RUT3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM89A2RUT3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM89A2RUT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM89A2RUT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM89A2RUT3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms