Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRGMA1A4Y4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms