Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM223A0PJW6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms