Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PQU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms