Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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