Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms