Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HBQ1P09105 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms