Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CDO00329 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms