Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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