Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms