Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP2A3Q93084 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms