Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms