Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTF1AQ7RTS3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTF1AQ7RTS3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTF1AQ7RTS3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTF1AQ7RTS3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTF1AQ7RTS3 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms