Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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