Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTCH1Q13635 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTCH1Q13635 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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