Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GGCXP38435 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms