Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms