Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZCCHC17Q9NP64 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms