Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms