Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms