Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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