Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMPOP42166 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms