Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms