Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms