Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms