Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms