Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GGCXP38435 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GGCXP38435 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GGCXP38435 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms