Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms